การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในกลุ่ม response regulator ภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือใน Halothece sp. PCC7418

ประภาภัทร บุญทองกุล

Please use this identifier to cite or link to this item: https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/78985

Title:	การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในกลุ่ม response regulator ภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือใน Halothece sp. PCC7418
Other Titles:	Gene expression analysis of response regulator under salt stress in a cyanobacterium Halothece sp. PCC7418
Authors:	ประภาภัทร บุญทองกุล
Advisors:	รุ่งอรุณ วาดิถี สิริศรัทธา
Other author:	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะวิทยาศาสตร์
Subjects:	ไซยาโนแบคทีเรีย -- ผลกระทบจากความเครียด การแสดงออกของยีน Cyanobacteria -- Effect of stress on Gene expression
Issue Date:	2563
Publisher:	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
Abstract:	ไซยาโนแบคทีเรียเป็นสิ่งมีชีวิตที่มีความสามารถในการสังเคราะห์แสง สามารถดำรงชีวิตอยู่ได้ใน สภาพแวดล้อมที่หลากหลาย แม้กระทั่งในสภาพแวดล้อมสุดขั้ว โดยหนึ่งในไซยาโนแบคทีเรียที่น่าสนใจ คือ Halothece sp. PCC7418 ที่สามารถอาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่มีความเค็มสูงได้ โดยกลไกสำคัญที่ทำให้ไซ ยาโนแบคทีเรียสามารถดำรงชีวิตในสภาพแวดล้อมที่หลากหลายได้ คือการมีระบบรับส่งสัญญาณที่เรียกว่า two component system (TCS) มีหน้าที่หลักในการตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงต่อสภาพแวดล้อม ซึ่ง ระบบดังกล่าวจะประกอบด้วยโปรตีน histidine kinase (HK) ทำหน้าที่รับสัญญาณสิ่งแวดล้อม และ response regulator (RR) ทำหน้าที่ควบคุมการตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อมของเซลล์ นอกจากนี้ยังพบโปรตีน รูปแบบอื่น คือ hybrid kinases (HyK) จากการสืบค้นข้อมูลจีโนมของ Halothece sp. PCC7418 พบว่ามียีน ในกลุ่ม RR 44 ยีน โดยเลือกมาศึกษา 17 ยีน ได้แก่ PCC7418_0084, PCC7418_0225, PCC7418_0226, PCC7418_0392, PCC7418_0469, PCC7418_0612, PCC7418_0618, PCC7418_0623, PCC7418_0892, PCC7418_1006, PCC7418_1046, PCC7418_1070, PCC7418_1116, PCC7418_1120, PCC7418_1121, PCC7418_1355, และPCC7418_1501 จากนั้นนำมาวิเคราะห์การ แสดงออกของยีนภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือโซเดียมคลอไรด์ ความเข้มข้น 2.0 โมลาร์ ด้วยวิธี semiquantitative RT-PCR พบว่า ยีน PCC7418_0612, PCC7418_1070, PCC7418_0892 และ PCC7418_1355 มีระดับการแสดงออกเพิ่มขึ้น (up-regulated) อย่างมีนัยสำคัญ นอกจากนี้ยังพบว่ายีน PCC7418_1116, PCC7418_1006, PCC7418_0225 และ PCC7418_0623 มีระดับการแสดงออกลดลง (down-regulated) อย่างมีนัยสำคัญ จากผลการทดลองแสดงให้เห็นว่า RR มีหน้าที่สำคัญต่อการปรับตัวของ Halothece sp.PCC7418 ภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือ
Other Abstract:	Cyanobacteria are phototrophic organisms, which can thrive in a wide range of ecological habitats, a group of marine, freshwater, terrestrial and extreme environments. Halothece sp. PCC7418 is extremophilic cyanobacterium, which can grow under high salinity condition. One of mechanisms that enable cells to survive in the harsh condition is signaling system called two-component system (TCS) that consists of two proteins: a histidine kinase (HK) and a response regulator (RR) that function together in a phosphotransfer pathway. From the entire genome analysis of Halothece sp. PCC7418, forty-four genes of RR were found. Seventeen genes of RR, PCC7418_0084, PCC7418_0225, PCC7418_0226, PCC7418_0392, PCC7418_0469, PCC7418_0612, PCC7418_0618, PCC7418_0623, PCC7418_0892, PCC7418_1006, PCC7418_1046, PCC7418_1070, PCC7418_1116, PCC7418_1120, PCC7418_1121, PCC7418_1355, and PCC7418_1501, were utilized for gene expression analysis under salt stress. Gene expression analysis by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) showed that PCC7418_0612, PCC7418_1070, PCC7418_0892 and PCC7418_1355 were up-regulated under high salinity condition (2M NaCl). In contrary, from the study showed that PCC7418_1116, PCC7418_1006, PCC7418_0225 and PCC7418_0623 were down-regulated under high salinity condition (2M NaCl). These experimental results showed that RR is important function for the environmental adaptation of Halothece sp. PCC7418 under salt stress.
Description:	โครงงานเป็นส่วนหนึ่งของการศึกษาตามหลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรบัณฑิต ภาควิชาจุลชีววิทยา คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ปีการศึกษา 2563
URI:	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/78985
Type:	Senior Project
Appears in Collections:	Sci - Senior Projects

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
63-SP-MICRO-011 - Praphapat Bunthongkun.pdf		34.88 MB	Adobe PDF	View/Open

Show full item record