Please use this identifier to cite or link to this item:
https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/80587
Title: | โปรแกรมประยุกต์สำหรับคำนวณอัตราส่วนนิวเคลียสต่อไซโทพลาซีมจากเซลล์ในน้ำช่องท้อง |
Other Titles: | Application for N/C ratio calculation from ascites fluid cell |
Authors: | กนกวรรณ ชาสุวรรณ ขนิษฐา ไกรขจรกิตติ |
Advisors: | สมใจ บุญศิริ |
Other author: | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะวิทยาศาสตร์ |
Subjects: | การสร้างภาพเพื่อการวินิจฉัยโรค การแพทย์ -- การประมวลผลข้อมูล Diagnostic imaging Medicine -- Data processing |
Issue Date: | 2563 |
Publisher: | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย |
Abstract: | โครงงานนี้มีจุดประสงค์เพื่อสร้างโปรแกรมประยุกต์คำนวณอัตราส่วนนิวเคลียสต่อไซโทพลาซึม (N/C ratio) จากเซลล์ในน้ำช่องท้อง เพื่ออำนวยความสะดวกแก่พยาธิแพทย์ แทนการอ่านค่าด้วยตาเปล่าโดยใช้กล้องจุลทรรศน์ ในการศึกษานี้ขั้นแรกแปลงภาพที่รับมาเป็นปริภูมิเอชเอสไอ จากนั้นใช้อัลกอริทึมการแบ่งกลุ่มแบบเคมีนในการหากลุ่มเซลล์ที่คล้ายกัน หลังจากนั้นแปลงเป็นภาพขาวดำ โดยใช้อัลกอริทึมค่าขีดแบ่ง ซึ่งจะได้จุดเล็ก ๆ ซึ่งเป็นสิ่งรบกวนปรากฎขึ้นมาในภาพ จากนั้นจึงใช้เทคนิค opening ในการกำจัดสิ่งรบกวนที่ปรากฏบนภาพ ถัดไปทำการแยกเซลล์ที่ติดกัน ต่อไประบุ unknown region เพื่อใช้สำหรับอัลกอริทึม watershed ซึ่งได้จุดศูนย์กลางของเซลล์ หลังจากนั้นใช้อัลกะริทึม watershed เพื่อแสดงขอบเขตของแต่ละเซลล์ถัดไปคำนวณระยะทางยูคลิเดียน ซึ่งจะได้พื้นที่ของนิวเคลียสและไซโทพลาซึม สุดท้ายคำนวณอัตราส่วนนิวเคลียสต่อไซโทพลาซึม โดยนำพื้นที่นิวเคลียสหารพื้นที่ไซโทพลาซึม ทำให้ได้อัตราส่วนนิวเคลียสต่อไซโทพลาซึม และแสดงผลทางหน้าจอ เพื่ออำนวยความสะดวกแก่พยาธิแพทย์ในการหาอัตราส่วนนิวเคลียสต่อไซโทพลาซึม |
Other Abstract: | The purpose of this project is to calculate the N/C ratio from ascites fluid cells to facilitate pathologist instead of reading the result by human eyes via microscope. This project uses the image processing technique to find the boundary of each cell by these processes that will be stated after this. First, we use HSV color separation. Second, we calculate the N/C ratio then uses algorithm k-means clustering to find a group of cell that looks similar and transforms to a grayscale image by using a threshold to get the noise image to contain a point in the image and uses the opening technique to remove noises in the image after that separate the adjacent cell and identify unknown region to identify the center of the cell and use watershed algorithm to find the boundary of the cell then calculate Euclidean distance to obtain nucleus and cytoplasm area. Finally, we calculate N/C ratio by using nucleus are divided by cytoplasm area and display on a web application to facilitate pathologist. |
Description: | โครงงานเป็นส่วนหนึ่งของการศึกษาตามหลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ปีการศึกษา 2563 |
URI: | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/80587 |
Type: | Senior Project |
Appears in Collections: | Sci - Senior Projects |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
63-SP-COMSCI-044 - Kanokwan Chasuwan.pdf | 38.75 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.